Kirken San Pedro de Atacama ligger i homonymosteinen torget i byen. Det er et viktig arkitektonisk landemerke og en av de eldste kirkene i landet.

Det finnes dokumenter som viser at i 1557 på nettstedet ble et kapell, som fungerte som en prest ikke cristóbal díaz de Los Santos. Den nåværende Kirken ble bygget på eiendommen til et kapell som Dateres tilbake til år 1745. Etter å ha 41 m i lengde og 7 5 m i bredde, Kirken San Pedro de Atacama ligner på et stort skip, mirakuløst funnet seg i Atacama ørkenen. I Kirken er en romslig nave, tverrskip og grasiøs bueganger. Alteret i Kirken, sannsynligvis den eneste av sitt slag i Chile, laget i Barokk stil, og er delt av kolonnene inn i tre deler med nisjer.

Fra Vest Kirken ble klokketårnet med fire klokker, bygget i 1782. Men i 1860, og tårnet ble ødelagt. I slutten av nittende århundre på dette stedet ble det reist en trekirke klokketårnet, som ble erstattet av en stein i 1964, i løpet av de neste gjenoppbygging av Kirken.

Det viktigste materialet som ble brukt i byggingen av Kirken, - stein og kalkstein. Alteret og buer hugget i stein. Taket er tekket og veggene er pusset med kalk, mørtel.

Kirken San Pedro de Atacama ble erklært et nasjonalt monument i Chile i 1951.