Museum for det forhistoriske Thera (Thira) ligger på øya Santorini i byen Fira. Gjenstander som presenteres i Museet var for det meste oppdaget under utgravninger på Akrotiri, utført under veiledning av den Arkeologiske forening i Athen. Det er i Museet og relikvier fra tidligere utgravninger på Potamos, som ble holdt under ledelse av den tyske arkeologiske Institutt i Athen, så vel som fra arkeologiske utgravninger i ulike deler av Santorini.

I samlingen til Museet presenterer keramikk av Neolittisk tid, tidlig Kykladisk figurer av marmor og keramikk, inkludert verker av overgangsperioden, innsamling av fartøy med bilder av fugler (hovedsakelig svelger) 20-18 århundre F.KR., og et utvalg av produkter fra metall. Museet er også utstilt innenlandske kjøkkenutstyr, veggmalerier, våpen, møbler, verktøy, bronsestatuer og mye mer. Siden toppen av den gamle bebyggelsen var i det 17. århundre F.KR., er mye av utstillingen tilhører denne perioden.

Den mest bemerkelsesverdige utstillinger inkluderer gull Steinbukken – dette er bare gull gjenstand ble funnet, var en gang skjult under gulvet. Også, bør vi nevne en marmor statuett fra Akrotiri Aksu (3000 F.KR.), en mugge island Christian (3000 F.KR.), en vase med liljer (17. århundre F.KR.), Minoiske vase fra Akrotiri Aksu (17. århundre F.KR.), en mugge fra Megalochori (tidlig i det 17. århundre F.KR.), avtrykk av et trebord (17. århundre F.KR.) og en leir ovn. Av spesiell interesse er vegg maleri, slik som "Blå monkeys" og "kvinnen med papyrus".

Museum for det forhistoriske Thera er ganske ung og ble åpnet for besøkende bare i 2000. Tidligere arkeologiske gjenstander funnet på Santorini, for det meste gikk til det nasjonale arkeologiske Museum i Athen, men etter åpningen av et lokalt Museum en del av samlingen ble returnert. Utstilling i Museet er svært interessante og har stor historisk betydning, som bekrefter hvor viktig stedet var okkupert Santorini i kultur på Øyene i Egeerhavet.