Katedralen i Arequipa er en av de første religiøse bygningene i byen. Den første Kirken ble bygget i 1544 av arkitekt Peter Godwineson under beskyttelse av Biskopen av Cuzco, ikke Freiem Vicente de Velarde. I 1583, jordskjelvet ødela templet. I 1590, Kirken ble gjenopprettet, men ikke for lenge. I 1600 på grunn av utbruddet av vulkanen Huaynaputina, templet igjen ble delvis ødelagt. I tidlig syttende århundre, Pave Paul V etablert bispedømmet av Arequipa, og på tuftene av den gamle Kirken fra 1621 i 1656 byggingen av Katedralen. Etter en ødeleggende brann i 1844, var Kirken i stand til å gjenopprette, ved arkitekt Lucas Poblete og med støtte fra Biskop Jose Sebastian de Gouines og Barreda i 1868.

I juni 2001 Arequipa byen ble ødelagt av et jordskjelv som målte 8, 1 poeng på Richters skala. Ett tårn av Katedralen ble fullstendig ødelagt, og skipet, buer og det andre tårnet ble hardt skadet. Etter et år, bryllupsdagen deres, Katedralen ble fullstendig restaurert under ledelse av Juan Manuel Guillen.

Katedralen er bygget behandlet av vulkansk stein og murstein i neo-Renessanse stil med en liten Gotisk innflytelse. Den største tempelet i byen er på Nord siden av Plaza de Armas Arequipa historiske sentrum. Fasaden består av sytti kolonner med Korintiske hovedsteder, tre dører og to store siden buer.

Alteret er laget av Carrara-marmor, og arbeidet med Felipe Moratilla. Unik stol skåret i eik fransk-Perle artist Rigaud fra Lille. I Museum of Katedralen inneholder dyrebare kunstverk, laget i Spania artist-gullsmed Francisco Moratilla, sølv krone Elizabeth II og mange andre gjenstander donert til Domkirke av Biskop Goyeneche og hans familie.