Arkeologiske Museet i Komotini ble offisielt grunnlagt i 1962 og er basert på arkeologiske samlinger samlet seg en gruppe av studenter på en av byens skoler, der, faktisk, gamle gjenstander og lagret i 1937-1962. I 1962, og samlingen ble plassert i en egen bygning, men på grunn av den stadige påfyll av Treasury av Museum nødvendig presserende utvidelse av utstillingsrommet. I 1968-1970 spesielt for Museet av den kjente arkitekten Konstadinidis av Api-ene ble det bygget en ny bygning og i dag regnes som en av de mest imponerende moderne strukturer i byen.

Unike relikvier, som er utstilt i det Arkeologiske Museet, som ble samlet inn gjennom Trakia, og dekker et stort tidsrom, fra Steinalder til den Bysantinske perioden, perfekt illustrerer historien om kulturelle utvikling av regionen, og understreker det unektelig innflytelse av de gamle Grekerne. Den viktigste utstillingen inneholder gjenstander fra forhistorisk bosetning, greske kolonier, Romerske bosetninger og gravsted. Utstillingen er presentert i kronologisk rekkefølge, og i samsvar med territoriell tilknytning av gamle gjenstander.

I det Arkeologiske Museet i Komotini du kan se keramikk og bronsestatuer, skulptur, smykker, mynter, våpen, begravelser artefakter, og mye mer. Den mest verdifulle element i samlingen er utvilsomt en Golden byste av den Romerske Keiser Septimius Severus (193-gg F.KR.).

Siden 1987, i det Arkeologiske Museet på en jevnlig basis, og tilbyr utdanninger for grunnskole og videregående skoler.
I dag er det Arkeologiske Museet i Komotini er en av de mest interessante severdighetene i byen.