Museum av Andean helligdommer ble etablert i 1996, etter et viktig arkeologisk forskning prosjektet "Helligdommer høyde Sur Andino", ledet av Dr Johan Reinhard og Jose Antonio Chavez. Museet er frosset "mumien Juanita" og andre emner av Inka-kulturen.

Studier utført av det Katolske Universitetet i Santa Maria for fire tiår i området av Arequipa, har gitt mange arkeologiske gjenstander, som nå er utstilt i sju haller av Museet. Den verdensberømte mamma Juanita, jenta i isen" med hennes medgift er en av de mest berømte utstillinger på Museet, som kan sees fra 1. mai til 31. desember hvert år. De resterende fire måneder av Juanita er i fullstendig mørke, for best bevaring av den frosne kroppen av en jente (kroppen hennes har ikke vært utsatt for prosessen med mumifisering). Juanita, også kjent som Lady Ampato, ble funnet i 1995 på skråningen av vulkanen Ampato i en høyde av 5800 meter over havet. Radiocarbon studie Juanita viste at hun var 530 år, nøyaktig tid for begravelse – 1466 annonsen.

Museet kan besøkende også se utstillinger laget av tre, metall, tekstil, gull og keramikk som ble brukt i seremonier av Inca Evnen Koch, Viracocha, samt gull og keramiske figurer, godt bevarte tepper.

For tiden research centre UCSM ved det Katolske Universitetet i Santa maría de Arequipa har 6 spesielle fryser, med en temperatur på 26°C under null, og to spesielle utstilling messe med å opprettholde en slik temperatur og datamaskinen kontroll av operatøren. Også i Museet installert aircondition for bevaringen av arkeologisk materiale.