Historien om Museet Aquitaine i Bordeaux tar teller i andre halvdel av det attende århundre – fra det øyeblikket Academy of Bordeaux ble grunnlagt Museum of stone skulptur, som ligger restene av den Romerske arv. Disse gjenstandene ble funnet under graving arbeider i urbane områder som jevnlig gjennomført i perioden fra XVI til XVIII århundre.

I 1963, som er den institusjonen ble omdøpt til Museum for historie, arkeologi og Etnografi, og ble også kjent som "the Museum of Aquitaine". I 1987, og Museet flyttet inn i det tidligere bygge på fakultetet for kunst og vitenskap, som ble bygget i slutten av XIX århundre på siden av klosteret, og er kjent som det gravstedet av forfatteren og filosofen Michel de Montaigne. Aquitaine Museum ligger i nærheten av Katedralen i St. Andrew.

I 2009 har Museet åpnet nye haller viet til en slik komplisert emne i historie av kolonimakten Frankrike som slaveri og menneskehandel. Bordeaux var den andre (etter Nantes havnen i Europa kom svarte slaver. Bare i Bordeaux ble levert ca 130 tusen slaver. Museet viser dokumenter og andre gjenstander som forteller om de vilkår som av livet og arbeidet til slaver, straff for opptøyene og rømming.

I dag, er det området av Museet er mer enn 5000 kvadratmeter, og innsamling av utstillinger har ca 70 tusen enheter. Alle disse elementene, dokumenter, kunst representerer historien av den historiske regionen Aquitaine, og dens viktigste byen Bordeaux. De tidligste gjenstander i denne samlingen går tilbake til forhistorisk epoken, mange av utstillingene er vitnesbyrd fra ulike times – Roman, tidlig Kristen Middelalder. Også i Museet kan du se utstillinger viet til den Maritime historien i Bordeaux, kunst av folkene i Afrika og Oseania.